フィラリアに感染すると心臓というより肺の血管がダメージを受けます。
フィラリアが寄生すると肺血管に炎症が生じたり、死んだフィラリア虫体が肺血管に梗塞を生じたりします。また、すべてのフィラリアを摘出することは不可能に近いですし、通常のフィラリア感染では摘出は行いません。（大静脈症候群と言って肺から心臓にフィラリアが移動した場合のみ摘出を行います。）
現在の状況がわかりませんが、心肺にダメージが少ないようでしたら治療を行うことで長期生存は可能です。残念ながらＩＰＳ細胞による治療は現時点ではありません。
感染しているようなら現在の心肺の状況を検査してもらい、早めに治療をされることをお勧めします。